第三代试管流程主要是通过需要双方进行相关的身体检查，比如血常规、乙肝检查、病毒、HIV等检查确定闭经以后，可以通过相关的遗传学进行咨询病史回顾，明确第3代试管婴儿的流程，然后通过女方进行超促排卵，一般打针10多天以后可以在B超上进行显示，然后将胚胎进行体外培养，培养5天左右以后植入到女性的宫腔中。
第三代试管婴儿技术也称为胚胎植入前遗传学诊断技术，一般需要完善双方的检查、制定方案、促排卵、胚胎培养，然后选择合适的胚胎解冻周期进行移植，具体步骤与常规试管婴儿较为类似，一般流程如下：
1、完善检查
需要双方进行相关的检查，如常规抽血检查乙肝、梅毒、HIV、丙肝、甲肝等，明确是否可以进行试管婴儿技术;
2、制定方案
通过所需要的相关遗传学咨询、病史回顾等，明确第三代试管婴儿技术的方案；
3、促排卵
女方需要进行超促排卵，一般打针十多天之后可以在B超引导下将卵子取出，同一天男方留取精液。精子和卵子在体外自然受精结合，或者将精子直接注射到女方的卵子内;
4、胚胎培养及移植
得到胚胎后需进行体外的胚胎培养，一般培养到第5天或第6天囊胚时，可以选取胚胎滋养外胚层细胞进行相关检测，确定胚否染色体是否正常、是否携带致病基因。检测正常的胚胎可以进行全胚冷冻，以备日后进行解冻胚胎的移植，完成试管婴儿的过程。
需要知道的是，第三代试管婴儿技术并不比第一代和第二代先进，只是针对的具体人群不同，第三代试管婴儿技术可以针对事先已经明确病因的单基因遗传病患者，如地中海贫血、白化病、血友病，可减少携带致病基因的患儿出生。还可以针对女方高龄、不明原因反复流产、不明原因反复种植失败，以及由于染色体的罗氏易位、相互易位等导致习惯性流产的患者，进行胚胎植入前遗传学的检测。
